dr Marta Zapotoczna, kierownik projektu
https://orcid.org/0000-0001-5971-1163 @martazapotoczna @aureuslibrary
mgr Paula Rożen, doktorantka
Celem moich badań jest ocena znaczenia poziomu adhezyjności izolatów bakteriemicznych Staphylococcus aureus do glikoprotein krwi, w tym fibrynogenu i fibronektyny na rozwój bakteriemii oraz identyfikacja zmienności genetycznej odpowiedzialnej za zróżniocowanie fenotypowe izolatów.
S. aureus wiąże się ze składnikami macierzy pozakomórkowej gospodarza, tj. fibrynogenem (Fg) i fibronektyną (Fn), poprzez zakotwiczone w ścianie komórkowej białka wiążące fibronektynę (FnBP) i fibrynogen (Clf). Poprzez te oddziaływania patogen stymuluje aktywację komórek odpornościowych gospodarza i reakcję zapalną prowadzącą do uwolnienia cytokin i rekrutacji komórek odpornościowych do miejsca zakażenia.
Przebadałam kolekcję 236 izoaltów bakteriemicznych oraz przeprowadziłam analizy asocjacyjne. Poziomy adhezji wykorzystaliśmy w analizach powiązań pomiędzy poziomami adhezji a wynikami klinicznymi pacjentów. Przeprowadziliśmy rówież badania asocjacyjne całego genomu, co pozwoliło na zidentyfikację determinantów genetycznych powiązane z różnymi poziomami adhezji.
Przebadałam kolekcję 236 izoaltów bakteriemicznych oraz przeprowadziłam analizy asocjacyjne. Poziomy adhezji wykorzystaliśmy w analizach powiązań pomiędzy poziomami adhezji a wynikami klinicznymi pacjentów. Przeprowadziliśmy rówież badania asocjacyjne całego genomu, co pozwoliło na zidentyfikację determinantów genetycznych powiązane z różnymi poziomami adhezji.
mgr Tomasz Buko, doktorant
Celem moich badań jest zrozumienie wzajemnego oddziaływania kofaktorów produkowanych przez Staphylococcocus aureus, w tym stafylokoagulazy i stafylokinazy. Kofaktory te modulują dynamikę tworzenia i rozpadu fibryny, co przekąłda się na tworzenie biofilmu i postęp bakteriemii i jej powikłań. Stafylokoagulaza aktywuje protrombinę, prowadząc do konwersji fibrynogenu do fibryny, która tworzy rusztowanie biofilmu i przyczynia się do utrzymywania się infekcji. I odwrotnie, stafylokinaza aktywuje plazminę, rozkładając fibrynę, umożliwiając rozprzestrzenianie się bakterii z biofilmów.
W moich badaniach wykorzystuję zmodyfikowane genetycznie izolaty bakteriemiczne badając wpływ czynników bakteryjnych na ww. procesy. Moje badania mają kluczowe znaczenie dla opracowania interwencji terapeutycznych mających na celu przerwanie tworzenia biofilmu i zapobieganie powikłaniom bakteriemii.
Dr Karol Makuch
karol.makuch@gmail.com www.karolmakuch.com
Studiowałem fizykę teoretyczną na Uniwersytecie Warszawskim, gdzie zajmowałem się miękką i kwantową materią skondensowaną. Po 2015 roku dołączyłem do grupy mikroprzepływowej w Instytucie Chemii Fizycznej PAN, gdzie zajmowałem się eksperymentami mikroprzepływowymi i biofizycznymi. Zajmowałem się również transportem cząsteczek w złożonych płynach i wewnątrz żywych komórek. Od marca 2019 do marca 2020 odwiedziłem grupę materii czynnej Johna Brady’ego w California Institute of Technology. W ramach projektu wykonuję analizę statystyczną danych biologicznych.
Dr Franesc Coll
Applied Microbial Genomics Unit, Department of Molecular Basis of Disease, Biomedicine Institute of Valencia (IBV), Spanish Research Council (CSIC), Valencia, Spain.
Department of Infection Biology, Faculty of Infectious and Tropical Diseases, London School of Hygiene & Tropical Medicine, London, UK.
Współpraca w zakresie tworzenia bazy danych klinicznych oraz badań powiązanych fenotypów:
Dr hab. Monika Budnik, Warszawski Uniwersytet Medyczny
Dr Halina Marchel, Warszawski Uniwersytet Medyczny
Dr Jan Pluta, Warszawski Uniwersytet Medyczny
Dr hab. Janusz Trzebicki, Warszawski Uniwersytet Medyczny
Dr Katarzyna Holcman, Uniwersytet Jagielloński
Dr Aldona Olechowska-Jarząb, Uniwersytet Jagielloński
Dr Adrianna Berger Kucza, Śląski Uniwersytet Medyczny
Prof. dr hab. Katarzyna Mizia-Stec, Śląski Uniwersytet Medyczny
Studenci:
Mgr inż. Marcin Małkowski, absolwent
Mgr inż. Karolina Mijas, absolwentka
Mgr Maciej Rykała, absolwent
Mgr Kacper Karczmarzyk, były członek zespołu
Mg Katarzyna Ścibek, były członek zespołu